Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms