Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms