Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Bco1Q9JJS6 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Bco1Q9JJS6 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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