Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnf6Q9DBU5 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rnf6Q9DBU5 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rnf6Q9DBU5 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rnf6Q9DBU5 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rnf6Q9DBU5 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf6Q9DBU5 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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