Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Atg4aQ8C9S8 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Atg4aQ8C9S8 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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