Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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