Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Traf3Q60803 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Traf3Q60803 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms