Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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