Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms