Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm28047Q3US59 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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