Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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