Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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