Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SbdsP70122 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SbdsP70122 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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