Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprkP35822 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprkP35822 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms