Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PcnaP17918 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PcnaP17918 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 657.4 ms