Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28038F7BCN9 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms