Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms