Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Speer3W4VSP1 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms