Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms