Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ube3bQ9ES34 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ube3bQ9ES34 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ube3bQ9ES34 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ube3bQ9ES34 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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