Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PtprtQ99M80 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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PtprtQ99M80 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtprtQ99M80 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprtQ99M80 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtprtQ99M80 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtprtQ99M80 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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PtprtQ99M80 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PtprtQ99M80 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprtQ99M80 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprtQ99M80 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprtQ99M80 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprtQ99M80 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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