Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ubxn4Q8VCH8 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms