Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Pcsk9Q80W65 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Pcsk9Q80W65 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms