Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccdc88cQ6VGS5 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms