Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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