Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Q3U6N9 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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