Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Ttc39dQ0VF76 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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Ttc39dQ0VF76 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ttc39dQ0VF76 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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Ttc39dQ0VF76 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ttc39dQ0VF76 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ttc39dQ0VF76 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ttc39dQ0VF76 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms