Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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