Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CftrP26361 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CftrP26361 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CftrP26361 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CftrP26361 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CftrP26361 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms