Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm3415J3QMS8 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms