Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms