Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms