Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hdac6Q9Z2V5 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms