Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms