Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms