Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rnft1Q9DCN7 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rnft1Q9DCN7 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnft1Q9DCN7 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnft1Q9DCN7 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnft1Q9DCN7 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rnft1Q9DCN7 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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