Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Smg9Q9DB90 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms