Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccdc47Q9D024 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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