Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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