Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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