Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Usp48Q3V0C5 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Usp48Q3V0C5 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms