Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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