Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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