Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprmP28828 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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