Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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RxraP28700 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RxraP28700 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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