Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PdgfraP26618 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms