Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms