Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms