Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms