Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms